Грамотрицательная гемолитическая палочка, неподвижная, не образующая капсул и спор, неустойчивая во внешней среде.

Bordetella pertussis - возбудитель коклюша, острого инфекционного заболевания с воздушно-капельным путем передачи, специфическим судорожным приступообразным кашлем и циклическим затяжным течением.

Основным источником инфекции является больной (дети и взрослые) типичной и атипичной формами коклюша, а также здоровые бактерионосители. Длительность бактерионосительства не изучена. Передача возбудителя осуществляется через воздух с мельчайшими капельками слизи при разговоре, крике, плаче, чихании, кашле. У инфицированного пациента возбудитель выделяется наиболее интенсивно в катаральном периоде и периоде спазматического кашля, далее интенсивность выделения возбудителя постепенно снижается и к 25-му дню больной коклюшем становится незаразным.

Типичная форма коклюша (с приступообразным судорожным кашлем) характеризуются цикличностью течения

период составляет от 3 до 14 суток. Характерные признаки: постепенное начало, удовлетворительное состояние больного, нормальная температура тела и сухой, навязчивый, постепенно усиливающийся кашель (основной симптом);

Bordetella parapertussis - возбудитель паракоклюша, острого инфекционного заболевания бактериальной природы, схожего по клинической картине с коклюшем, но протекающее мягче и, как правило, без осложнений.

Периоды заболевания:

инкубационный период – с 1 по 14 день (в среднем 7-8 дней);

катаральный – около 4-5 дней;

спазматический – до 5 недель;

Симптомы паракоклюша проявляются с разной интенсивностью в зависимости от формы течения. Это может быть охриплость голоса, общая слабость и недомогание, насморк, непродолжительный кашель, покраснение задней стенки гортани. Возможно повышение температуры до субфебрильных значений. На начальном этапе клинические проявления заболевания, как правило, отсутствуют.  В спазматический период судорожные приступы кашля появляются внезапно в виде коротких толчков один за другим, между ними отмечаются глубокие свистящие вдохи. 

внутриклеточный паразитарный микроорганизм, источник инфекционного поражения органов дыхания. Он не способен самостоятельно синтезировать АТФ и другие метаболические ресурсы энергии, поэтому может существовать только внутри клеток.

C. pneumoniae вызывает острые и хронические инфекции верхних дыхательных путей и бронхопневмонию. Для хламидийной пневмонии характерны респираторные проявления (ринит, трахеобронхит), малопродуктивный кашель, субфебрильная и фебрильная температура, внелегочные симптомы (артралгия, миалгия).

C. pneumoniaе передается только от человека к человеку. Вспышки респираторных заболеваний хламидийной этиологии чаще бывают в тесных коллективах. У 70 % зараженных Chlamydia pneumoniae может бессимптомно находиться в дыхательных органах. Инкубационный период точно не установлен. Иногда заболевание проявляется через много месяцев после инфицирования, а бактерии способны длительно сохраняться на слизистых верхних дыхательных путей даже после выздоровления человека.

Cамый известный и наиболее изученный представитель рода Mycoplasmoides, причина респираторного микоплазмоза и главный возбудитель атипичной пневмонии.

Основные симптомы атипичной пневмонии: лихорадка, общее недомогание, головная боль, а также кашель, который усиливается в течение 1–2 дней и может стать мучительным. В 5-10 % случаев развивается трахеобронхит или пневмония, для которых характерен мучительный кашель с трудноотделяемой мокротой, иногда – с прожилками крови.

M.pneumoniae передается воздушно-капельным путем от больного микоплазмозом или бессимптомного носителя.. Инкубационный период составляет 2-3 недели.

семейство ДНК-содержащих вирусов, лишённых липопротеиновой оболочки. Аденовирусы имеют диаметр 70—90 нм, содержат единичную двухцепочечную молекулу ДНК. Аденовирусы устойчивы во внешней среде: при комнатной температуре сохраняются в течение 2 недель, выдерживают низкие температуры и высушивание. Вместе с тем, возбудитель аденовирусной инфекции инактивируется под воздействием ультрафиолетовых лучей и хлорсодержащих дезинфектантов.

Выделяют три формы аденовирусной инфекции:

·Легкая форма — поражаются верхние дыхательные пути и горло;

·Среднетяжелая форма — проявляется лимфаденопатией (воспалением лимфатических узлов), гиперплазией лимфоидной ткани;

·Тяжелая форма — вызвана вторичной инфекцией либо генерализацией вируса.

 Обычно заболевание начинается остро, но симптомыпроявляются последовательно. На начальном этапе постепенное повышается температура тела до 38-39°С (реже до 40°С),ко 2-3-му дню появляются атаральные явления в верхних дыхательных путях. Также отмечаются незначительная вялость, общая слабость, ухудшение аппетита, возможна головная боль.

Коронавирусы (Coronaviridae) — это семейство РНК-содержащих вирусов, включающее более 45 видов, объединённых в два подсемейства.

Источником коронавирусной инфекции могут быть больной человек и животные. Возможные механизмы передачи: воздушно-капельный, воздушно-пылевой, фекально-оральный, контактный. Заболеваемость растёт зимой и ранней весной. Вне пандемии в структуре ОРВИ госпитализированных больных коронавирусная инфекция составляет в среднем 12 %. О широкой распространённости коронавирусов свидетельствуют специфичные антитела, выявленные у 80 % людей.

HCoV-229E — вид вирусов, который поражает людей и летучих мышей. Инфекция может протекать как в форме простуды, так и в тяжёлых формах заболевания, включая пневмонию и бронхит. Наиболее часто обнаруживается вместе с другими респираторными вирусами, особенно с респираторно-синцитиальным вирусом человека (HRSV).

HCoV-HKU1 был выделен у взрослых с пневмонией. ОРВИ вызывает атипичную пневмонию, которая несет 10% летальности.

HCoV-NL63 является важной причиной тяжелых инфекций нижних дыхательных путей у взрослых и детей.

HCoV-OC43 является одним из известных вирусов, которые вызывают простуду. Вирус может вызвать серьезные инфекции нижних дыхательных путей, в том числе пневмонии у детей раннего возраста, пожилых людей и ослабленных лиц.

Вирус парагриппа человека типа 1 HPIV-1 чаще всего определяется у детей в возрасте от 6 месяцев до 6 лет и вызывает ложный круп (затруднение дыхания вследствие сужения просвета гортани в результате ее воспаления). Этот тип вируса является причиной большинства случаев ларингита у взрослых  и у детей.

Вирус парагриппа человека типа 2 HPIV-2 вызывает ларингит, ложный круп и другие заболевания верхних и нижних дыхательных путей (фарингит, бронхит и пневмонию).

Вирус парагриппа человека типа 3 HPIV-3 вызывает ларингит, ложный круп, нередко развитие бронхиолита и пневмонии.

Вирус парагриппа человека типа 4 HPIV-4, вклющий подтипы 4a и 4b, встречается редко и может вызывать не только ларингит, но и различные по тяжести и локализации поражения дыхательных путей.

Продолжительность инкубационного периода вируса парагриппа любого типа составляет в среднем около недели. Признаками острой фазы заболевания служат внезапное повышение температуры, заложенность носа, недомогания, головная боль. Основным клиническим признаком является поражение верхних дыхательных путей. Пациентов беспокоят надсадный, сухой, мучительный кашель, жжение, саднение в горле, охриплость голоса, заложенность носа, слизисто-гнойное отделяемое из носовых ходов. При осмотре слизистая глотки отечная, красная, миндалины увеличены, красные. Нередко первым признаком проявления инфекции у детей до 2–5 лет является неожиданно развившийся синдром крупа.

Метапневмовирус человека (англ. Human metapneumovirus, hMPV) — вид РНК-содержащих вирусов из семейства Pneumoviridae. Вызывает у человека, преимущественно у детей, ОРВИ, затрагивая не только верхние, но и нижние дыхательные пути. У взрослых практически здоровых людей вирус вызывает ОРЗ в легкой форме. Тяжелые или среднетяжелые формы заболевания hMPV отмечены у детей первых лет жизни, у пожилых пациентов и пациентов с иммунодефицитом.

Общая продолжительность МПВ-инфекции составляет от 4 до 13 дней. Основные симптомы инфекции - кашель, насморк, одышка, лихорадка, головная боль, редко желудочно-кишечные расстройства.

Согласно исследованиям МПВ занимает важное место в структуре этиологии ОРВИ у детей до 7 лет и особенно до года. С этим вирусом связано 41,18% случаев всех острых бронхитов среди госпитализированных пациентов грудного возраста.

Энтеровирусы это РНК-содержащие вирусы, относящиеся к семейству Picornaviridae.

Энтеровирусы (греч. enteron - кишка) представляют собой группу вирусов, проникающих в организм человека преимущественно через желудочно-кишечный тракт и вызывающих разнообразные по клиническим проявлениям болезни.

Энтеровирусы длительно (месяцами) сохраняются в воде, почве, некоторых пищевых продуктах и на предметах обихода. Многие дезинфектанты (спирт, фенол, ПАВ) малоэффективны в отношении энтеровирусов. Энтеровирусы погибают под действием УФ-лучей, окислителей, формалина. При кипячении они погибают в течение нескольких секунд.

Энтеровирусы поражают различные органы и ткани:

- ЦНС (полиомиелит, полиомиелитоподобные заболевания);

- органы дыхания (острые респираторные заболевания);

- пищеварительный тракт (гастроэнтерит);

- кожу и слизистые оболочки (конъюнктивит, лихорадочные заболевания с

сыпью и без нее) и др

Риновирусы - типичные РНК-содержащие пикорнавирусы, относящиеся к семейству Picornaviridae. Риновирусы могут передаваться двумя механизмами: аэрозольным и контактно-бытовым. Входные ворота - нос, полость рта, слизистая глаз.

Инкубационный период вируса составляет 1-5 суток. Клинически заболевание проявляется в виде острой респираторной вирусной инфекции (ОРВИ). Риновирусная инфекция характеризуется заложенностью носа, чиханием, насморком, подъемом температуры до 38°С, ознобом, першением в горле, покашливанием, общим недомоганием.  У детей риновирусная инфекция сопровождается лихорадкой, у взрослых повышение температуры наблюдается редко. Продолжительность заболевания составляет 5-9 суток.

MERS-CoV был выявлен в 2012 году в качестве причины Ближневосточного респираторного синдрома (MERS). Вирус MERS-CoV более стабилен в условиях низкой температуры и низкой влажности. По имеющимся представлениям MERS-CoV способен вызывать тяжелую острую респираторную инфекцию, проявляющуюся в форме пневмонии. В организме человека вирус имеет выраженное сродство к клеткам бронхиального эпителия.

MERS-CoV инфекция может протекать как практически бессимптомно, так и с поражением верхних дыхательных путей, с быстрым развитием пневмонии, дыхательной недостаточности, ОРДС, а также с развитием септического шока и полиорганной недостаточностью. В некоторых случаях могут наблюдаться такие симптомы, как тошнота, диарея, необильная рвота. НЧаще всего MERS-CoV инфекция регистрируется у взрослых, хотя имеются случаи заболевания и детей. Большинство госпитализированных пациентов с MERS-CoV имели хронические сопутствующие заболевания.

Респираторно-синцитиальный вирус (РСВ) человека принадлежит к роду Pneumovirus семейства Paramyxoviridae. РСВ повсеместно распространён, вспышки инфекции наблюдаются в холодное время года. Вирус выделяется больным человеком в течение 5 - 7 дней от начала болезни и передается воздушно-капельным путём

В большинстве случаев у здоровых детей и взрослых РСВ инфекция протекает как заболевание верхних дыхательных путей в виде ринита, фарингита, ларингита. Бессимптомное течение инфекции не характерно. Инкубационный период длится от 3 до 5 дней. Общая продолжительность заболевания составляет от 5-7 дней до 3-х недель.

Грипп (Grippus, Influenza) — острая инфекционная болезнь с аэрозольным механизмом передачи возбудителя, характеризующаяся массовым распространением, кратковременной лихорадкой, интоксикацией и поражением респираторного тракта.

Возбудителями гриппа являются РНК-содержащие вирусы, которые входят в семейство ортомиксовирусов (Оrthomyxoviridae). Семейство включает несколько родов, в том числе поражающие человека вирусы гриппа типа A (род Influenzavirus A) и вирусы гриппа типа B (род Influenzavirus B).

Источником инфекции является больной человек в остром периоде заболевания (первые 5 – 7 дней болезни), в том числе с легкой или бессимптомной формой, реже – реконвалесцент, выделяющий вирус, в среднем, в течение двух недель от начала заболевания. Пути передачи вируса: воздушно-капельный и воздушно-пылевой пути, реже контактно-бытовой.

Типичный грипп у взрослых характеризуется внезапным появлением озноба, лихорадки, прострации, кашля и генерализованных болей (особенно в спине и ногах). Сильная головная боль, часто со светобоязнью и болями в заглазничном пространстве. Вначале респираторные симптомы могут быть легкими, с перхотью в горле, жжением за грудиной, непродуктивным кашлем и иногда насморком. Позже заболевание нижних дыхательных путей становится преобладающим; кашель может быть стойким, хриплым и продуктивным. Могут возникать желудочно-кишечные симптомы, которые, по-видимому, чаще встречаются у пандемического штамма H1N1 2009 года . У детей может быть выраженная тошнота, рвота или боль в животе, а у младенцев может быть синдром, подобный сепсису. Через 2–3 дня острые симптомы быстро проходят, хотя лихорадка может длиться до 5 дней. Кашель, слабость, потливость и утомляемость могут сохраняться в течение нескольких дней, а иногда и недель.

Одним из частых осложнений гриппа является пневмония. Развившиеся на фоне вирусной инфекции пневмонии относят к первичным вирусно-бактериальным (чаще всего стрептококковой и стафилококковой этиологии). Они чаще развиваются у пациентов группы «высокого риска»: с хроническими заболеваниями легких и сердца, лиц пожилого возраста